CPU구조와 작동원리를 모르신다면 쉽게 이해할 수 없으실텐데요..
정답은, 어떤 OS에서 어떤 프로그램을 (동시에) 돌리느냐에 따라 다릅니다.
단, 요즘 같은 환경이라면, 다른 것이 전부 같다고 가정했을 때 듀얼코어가 더 나을 겁니다.
한번에 단 한개의 프로세스만 진행되는 것이 아니기 때문에, 2차선이 1차선보다 낫습니다.

그러나, 말씀드렸다시피 얼마든지 그 반대의 케이스를 찾아낼 수도 있습니다.

기본적으로 벤치마크상의 기록만으로 본다면 싱글코어 2Ghz가 일반적으로 더 높은 성능을 제공합니다... 이유는 동일한 코어라면 일처리를 분배하는 시간에 혼자 빠르게 해결하는게 좋기 때문입니다...(단일 스레드 기준)

단, 애초 듀얼코어에 맞춰 디자인된 프로그램을 돌리고, 처리해야 되는 개개의 일이 수준이 낮은 일일 경우에는 듀얼 1Ghz가 좋을 수는 있습니다...

하지만 기본적으로 듀얼이나 쿼드등을 사용하는 이유는 각 코어당 부하량을 분산시켜 딜레이(랙) 없는 환경을 만들기 위함이죠...
윈도우나 기타 운영체제들도 듀얼 코어 이상의 시퓨가 일상적인 수준으로 퍼짐에 따라 멀티 스레드를 이용할 수 있게 변하면서 일반적인 사용시 듀얼코어가 더 좋은 느낌을 받죠...

쉬운 예로 최근 출시되는 인텔 시퓨들이 터보 클럭 작동시 다른 코어들의 속도를 줄이고, 하나의 코어만 고클럭으로 올립니다...(이때 개별 코어들의 클럭을 단순히 더하면 터보클럭일 때의 수치가 더 낮죠..)

자세하게 파고들면 할 얘기가 많지만 일반적으로 같은 아키텍쳐라면 후자가 낫습니다.